Iniciou em 1981 o seu percurso no desporto como jogador no Mem Martins Sport Clube, tendo chegado à 2.ª Divisão Nacional (atualmente 2.ª Liga), onde encerrou a carreira de jogador no Clube Oriental de Lisboa em 2002. Iniciou de imediato a carreira de treinador de guarda-redes, passando por clubes de renome como o Sport Lisboa e Benfica, C.F. Os Belenenses, Rio Ave FC, Grupo Sportivo Sacavenense, Shanghai Port (China) e até pela Seleção Nacional de Itália no Euro 2004.

Homem de coragem e entrega, ingressou na Força Aérea Portuguesa em 1987 e, no ano seguinte, na Guarda Nacional Republicana, onde serve até hoje, atualmente na Unidade Nacional de Trânsito, herdeira da antiga Brigada de Trânsito. Ao longo destas décadas, Rui Marques tem demonstrado compromisso, espírito de missão e um sentido de dever inabalável.